En el siglo IV d.C. las calles de Alejandría viven un momento turbulento como consecuencia de las revueltas religiosas entre cristianos, judíos y paganos. El conflicto pone en peligro la célebre biblioteca de la ciudad, que es custodiada por la científica y astrónoma Hipatia. La mujer no dudará en poner su vida en peligro para salvar los libros y el saber de la cultura antigua con ayuda de sus discípulos. Entre ellos se encuentran dos hombres muy diferentes que están enamorados de ella: Orestes, un joven aristócrata, y Davo, uno de los esclavos del padre de Hipatia, y que se debate entre la lealtad que le profesa a su ama y la libertad que sabe que conseguirá si se une a los cristianos.